Crkva je izgrađena prije 1332. godine ispod tvrđave Isar, a posvećena je sv. Arkanđelu Mihaelu, kao jednom od glavnih zaštitnika grada.
Crkva je izgrađena od sivozelenog pješčenjaka i opeke, skladnih arhitektonskih oblika i slikovitih pročelja. U osnovi je križolikog oblika s poligonalnom apsidom dimenzija 13,30 x 8,40 m s kupolom i narteksom, dograđenim kasnije, koji je srušen početkom 20. stoljeća.
Nosiva konstrukcija sastoji se od dva uzdužna i dva poprečna zida debljine 120 cm i četiri stupa koji podupiru kupolu.
U crkvi nema sačuvanih fresaka, a pretpostavlja se da je uništena za vrijeme vladavine Turaka kada je pretvorena u džamiju. Za to turski putopisac Evlija Čelebija, koji je boravio u Štipu 1661. godine, pišući o džamijama, navodi da je fetkija, fitija, džamija koja se nalazila ispod tvrđave Isar, bila crkva za vrijeme osvajanja, koju je Ali-beg pretvorio u džamiju.
Komponente objekta:
Crkva sadrži četiri prijestolne ikone registrirane od strane Republičkog zavoda za zaštitu spomenika kulture (prema zapisniku br. 0801-27 od 3.06.1985., Štip), i to:
-Sv. Djevica Marija SK-18377
-Isus Krist SK-18380
-Sv. Arkanđeo Mihael SK-18383
-Sv. Ivan Krstitelj SK-18387
Zvonik u dvorištu.
