Црква је саграђена пре 1332. године испод тврђаве Исар, а посвећена је Светом Архангелу Михаилу, као једном од главних заштитника града.
Црква је изграђена од сивозеленог пешчара и цигле, са складним архитектонским облицима и сликовитим фасадама. У основи је крстообразна грађевина са полигоналном апсидом димензија 13,30 x 8,40 м са куполом и нартексом, додатим касније, који је срушен почетком 20. века.
Носива конструкција се састоји од два уздужна и два попречна зида дебљине 120 цм и четири стуба који носе куполу.
У цркви нема сачуваних фресака, а претпоставља се да је уништена током владавине Турака када је претворена у џамију. За ово турски путописац Евлија Челебија, који је боравио у Штипу 1661. године, пишући о џамијама, указује да је феткија, фитија, џамија која се налазила испод тврђаве Исар, била црква током освајања, коју је Али-бег претворио у џамију.
Компоненте објекта:
Црква садржи четири престоне иконе које је регистровао Републички завод за заштиту споменика културе (према записнику бр. 0801-27 од 3.06.1985. године, Штип), и то:
-Света Богородица SK-18377
-Исус Христос SK-18380
-Свети Арханђео Михаило SK-18383
-Свети Јован Крститељ SK-18387
Звоник у дворишту.
