Kisha u ndërtua para vitit 1332 nën fortesën Isar dhe i është kushtuar Shën Kryeengjëllit Mikael, si një nga mbrojtësit kryesorë të qytetit.
Kisha është ndërtuar me gur ranor gri-jeshil dhe tulla, me forma arkitekturore harmonike dhe fasada piktoreske. Në thelb është një ndërtesë në formë kryqi me një absidë poligonale me përmasa 13.30 x 8.40 m me një kupolë dhe një narteks, të shtuar më vonë, i cili u shemb në fillim të shekullit të 20-të.
Struktura mbajtëse përbëhet nga dy mure gjatësorë dhe dy tërthor me trashësi 120 cm dhe katër shtylla që mbështesin kupolën.
Në kishë nuk ka afreske të ruajtura dhe supozohet se është shkatërruar gjatë sundimit të turqve kur u shndërrua në xhami. Për këtë, shkrimtari turk i udhëtimeve Evlija Çelebija, i cili qëndroi në Shtip në vitin 1661, duke shkruar për xhamitë, tregon se fetkija, fitija, një xhami e vendosur nën fortesën e Isarit, ishte kishë gjatë pushtimit, të cilën Ali Beu e shndërroi në xhami.
Komponentët e pronës:
Kisha përmban katër ikona froni të regjistruara nga Instituti Republikan për Mbrojtjen e Monumenteve të Kulturës (sipas procesverbalit nr. 0801-27 të datës 3.06.1985, Shtip), përkatësisht:
-Shën Virgjëresha Mari SK-18377
-Jezu Krishti SK-18380
-Shën Kryeengjëlli Mikael SK-18383
-Shën Gjon Pagëzori SK-18387
Këmbana në oborr.
