Църквата е построена преди 1332 г. под крепостта Исар и е посветена на Свети Архангел Михаил, като един от главните защитници на града.
Църквата е построена от сиво-зелен пясъчник и тухли, с хармонични архитектурни форми и живописни фасади. Тя представлява в основата си кръстовидна сграда с многоъгълна апсида с размери 13,30 х 8,40 м с купол и притвор, добавен по-късно, който е разрушен в началото на 20-ти век.
Носещата конструкция се състои от две надлъжни и две напречни стени с дебелина 120 см и четири стълба, които поддържат купола.
В църквата няма запазени стенописи и се предполага, че е разрушена по време на управлението на турците, когато е превърната в джамия. За това турският пътеписец Евлия Челебия, който е отсядал в Щип през 1661 г., пишейки за джамии, посочва, че феткията, фития, джамия, разположена под крепостта Исар, е била църква по време на завладяването, която Али бей е превърнал в джамия.
Компоненти на имота:
Църквата съдържа четири тронни икони, регистрирани от Републиканския институт за защита на паметниците на културата (съгласно протокол № 0801-27 от 3.06.1985 г., Щип), а именно:
-Света Богородица SK-18377
-Исус Христос SK-18380
-Свети Архангел Михаил SK-18383
-Свети Йоан Кръстител SK-18387
Камбанарията в двора.
